この問題はスカルプでいろいろモデリングしていると、たびたび出くわすと思います。
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ボックス表示では、まっすぐにそろえているのに、スムーズ表示にすると曲がる。これに関しての解決方法は２つあります。（ほかにもあるかもしれませんが）まずは１つ目：再分割コマンドを使う方法
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まずは余計なエッジを消します。これによりスムーズなエッジを確保。
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次に再分割コマンドで、挿入モード：固定にした状態で面を分割していきます。
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この分割方法によってディテールを加えてもスムーズなエッジを確保したままモデリングしていくことができます。

 

そして２つ目の方法：押し出し
Twitterから転載


”フォームを編集”コマンドで端のエッジを押し出しています。

（操作はAlt押しながら矢印ドラッグ）
なぜか端のエッジを押し出すことで、ぐにゃっと曲がっている面・エッジがスムーズになります。
押し出した後、削除しても再度ぐにゃっと曲がることはありません。